Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms