Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ArxO35085 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ArxO35085 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ArxO35085 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ArxO35085 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms