Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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