Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casq1O09165 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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