Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms