Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3424L7N298 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm3424L7N298 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3424L7N298 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms