Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms