Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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