Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkal1J3QPP8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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