Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gm5225J3QPL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gm5225J3QPL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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