Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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