Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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