Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c2J3QNM1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms