Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20830J3KML6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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