Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms