Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms