Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef1G3X9K3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms