Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms