Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms