Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms