Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms