Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms