Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms