Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms