Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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