Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20671F6TVX7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20671F6TVX7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms