Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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