Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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