Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L6

Foxn2, Forkhead box N2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn2E9Q7L6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxn2E9Q7L6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxn2E9Q7L6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms