Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gcnt4E9Q649 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcnt4E9Q649 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms