Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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ApobE9Q414 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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ApobE9Q414 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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ApobE9Q414 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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ApobE9Q414 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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