Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzd2E9Q1M1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzd2E9Q1M1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzd2E9Q1M1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzd2E9Q1M1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pdzd2E9Q1M1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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