Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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