Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx60E9PZQ1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms