Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5415E9PXF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5415E9PXF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms