Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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