Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms