Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms