Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms