Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rfx8D3YU81 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rfx8D3YU81 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rfx8D3YU81 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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