Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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