Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms