Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clrn2B2RVW2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms