Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AU015836B2RUM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AU015836B2RUM3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AU015836B2RUM3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AU015836B2RUM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AU015836B2RUM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AU015836B2RUM3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms