Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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