Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zscan5bB2RTN3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms