Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms