Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms