Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms