Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms